El Fondo Nacional de Desarrollo Pesquero FONDEPES fue creado mediante Decreto Supremo Nº 010-92-PE, de fecha 5 de junio de 1992, modificado por Decreto Supremo Nº 015-92-PE, producto de la fusión del Fondo de Desarrollo Pesquero Artesanal FONDEPA, Fondo de Reactivación del Sector Pesquero FONRESPE, Programa de infraestructura Pesquera Artesanal PDIPA y el Fondo de Financiamiento de Infraestructura Pesquera FOFIP, mediante artículo 57º del Decreto de Ley Nº25997, Ley General de Pesca, se le da fuera del Ley al Decreto Supremo Nº010-92-PE que crea el Fondo Nacional de Desarrollo Pesquero – FONDEPES, así como a sus normas modificatorias, el cual es un Organismo Público sujeto a las normas aplicables a las Empresas del Estado, bajo ámbito del CONAFI, adscrito al Ministerio de la Producción.