En agosto de 2003 el gobierno del Estado de Tabasco, con el apoyo del Gobierno Federal inició los trabajos de creación de la Universidad Tecnológica del Usumacinta, siendo la segunda Universidad Tecnológica en el Estado de Tabasco. La Secretaría de Educación del Gobierno del Estado, realizó las gestiones ante la Coordinación General de Universidades Tecnológicas (CGUT) de la Secretaría de Educación Pública (SEP). Para contar con mayores elementos que justificaran la creación de dicha institución, fue necesario realizar un estudio de factibilidad que incluyó el estudio de mercado laboral, estudio de oferta y demanda educativa, estudios socioeconómicos y de expectativas educativas, mismos que fueron realizados en la Región de los Ríos del Estado de Tabasco.Como resultados del estudio de mercado laboral y sobre las propuestas de carreras, se detectaron las necesidades específicas de las empresas de la región, y con esto se opto por abrir las carreras de Técnico Superior Universitario en: Procesos Agroindustriales, Biotecnología y Comercialización.