Η ΕΥΔΕ-ΕΤΑΚ συστάθηκε το 2008 ως Ειδική Υπηρεσία που υπάγεται στον Γενικό Γραμματέα Έρευνας και Τεχνολογίας, με αποστολή το σχεδιασμό, την εφαρμογή και τη διαχείριση Δράσεων στους τομείς της Έρευνας, της Τεχνολογικής Ανάπτυξης και της Καινοτομίας (ΕΤΑΚ). Αποτελεί ευέλικτη δομή με πολύ εξειδικευμένο και έμπειρο προσωπικό. Στο πλαίσιο του ΕΣΠΑ 2007-2013, χειρίζεται σημαντικές Δράσεις Κρατικών Ενισχύσεων στους τομείς ΕΤΑΚ με προϋπολογισμό της τάξεως των 240 εκ. €. Αξιοποιώντας τη συσσωρευμένη εμπειρία της, η ΕΥΔΕ-ΕΤΑΚ θα αποτελέσει το βασικό πυλώνα διαχείρισης για την ενιαία Δράση Κρατικών Ενισχύσεων ΕΤΑΚ στο πλαίσιο του ΕΣΠΑ 2014-2020, με συνολική Δημόσια Δαπάνη 280 εκ. €. Η Ειδική Υπηρεσία στοχεύει στην εξοικονόμηση πόρων, την επιτάχυνση των διαδικασιών και τη διασφάλιση της τήρησης των αρχών της νομιμότητας, της διαφάνειας και της ίσης μεταχείρισης των δικαιούχων. Αναπτύσσει σύγχρονες, αυτοματοποιημένες διαδικασίες διαχείρισης έργων, με ηλεκτρονικά εργαλεία και συστήματα όπως, ηλεκτρονικές πλατφόρμες αξιολογήσεων και πιστοποιήσεων, ηλεκτρονικά μητρώα αξιολογητών και πιστοποιητών, κ.λπ.