A Cooperativa é fruto da iniciativa de uma equipe de médicos que, de um lado fundaram a MATERCOOP (Cooperativa de Especialidades Médicas), e de outro criaram a COOPERDEI(Cooperativa dos Profissionais na Área de Saúde). Da fusão de ambas as entidades surgiu uma nova cooperativa, a Unicooper, em 22 de junho de 1999. A Unicooper congrega os cooperados que atuam no Hospital Mater Dei e, como está expresso em seu nome, surge com uma proposta unificada e voltada para o fortalecimento do trabalho cooperativista dos profissionais de Medicina.