O modelo de Educação a Distância (EAD) da UNEF tem conceito máximo pelo MEC. Apoia-se em uma metodologia flexível e adaptável em função dos objetivos da aprendizagem, do público alvo e dos recursos disponíveis para cada projeto pedagógico específico. As diretrizes gerais englobam os pressupostos pedagógicos do ensino a distância e obedecem à legislação em vigor, para todos os processos. As atividades são realizadas no Polo de Apoio Presencial – unidade operacional para o desenvolvimento descentralizado das atividades pedagógicas e administrativas relativas aos cursos e programas ofertados a distância. É o local de encontro dos alunos onde acontecem os momentos presenciais, o acompanhamento, a orientação para os estudos, as avaliações presenciais, as práticas laboratoriais e de campo. No modelo da UNEF, o acesso ao mundo digital ocorre através de várias ferramentas que permitem a interação tecnológica com diferentes meios. O diálogo, a interlocução de maneira direta ou mediada entre os agentes (alunos, professores e tutores) é intenso, contínuo e de permanente aperfeiçoamento, a partir da prática de mediatização pedagógica a ser desenvolvida. Assim, a mediação pedagógica resulta na criação de materiais educativos (textos), metodologias de ensino e de estudo, estratégias de uso dos recursos de ensino e os meios mais adequados para produção de materiais necessários e adaptados a cada curso. As aulas presenciais são desenvolvidas através de videoaulas acompanhadas pelo tutor presencial, que participa dos chats e fóruns de discussão, orientados pelos professores, como forma de aprofundamento, debate e revisão dos conteúdos ministrados. Os Referenciais de Qualidade para EAD apresentam as dimensões que devem compor o Projeto Político Pedagógico dos cursos na modalidade a distância e trazem como aspectos fundamentais, dentre outros, a equipe multidisciplinar destacada pelo tutor e seu papel no processo educacional onde o estudante deve ser o centro do processo.