O Nepuga/FAPUGA visa proporcionar tanto a alunos como a docentes as melhores condições para que as metas de aprendizado sejam alcançadas. A visão metodológica do Nepuga/FAPUGA promove um alto grau de interação entre os alunos, tirando vantagem da diversidade em termos de formação, experiência prévia, áreas de atuação, entre outros aspectos. Ao mesmo tempo, a estrutura dos programas de ensino do Nepuga/FAPUGA contempla uma distribuição de carga horária e dias no mês, dando ao aluno a chance de acessar o professor para tirar dúvidas sobre a matéria lecionada. Este atendimento pode ser feito pessoalmente ou via plataforma interativa, conforme orientação do programa de ensino.