Plusieurs équipes de recherche en France sont très actives et visibles dans des domaines spécifiques de la physiopathologie de l'appareil digestif : les maladies inflammatoires de l'intestin, la maladie coeliaque, les troubles de la motilité intestinale, ou de l'absorption du fer et ces pathologies hépatiques associés par exemple. Ces expertises se sont structurées et regroupées au sein d'une structure de recherche unique. En effet, unifier des expertises sur la fonction de la barrière intestinale, le microbiote, l'immunologie des muqueuses, la neurogastroentérologie et le métabolisme du fer offre une occasion unique d'aborder les pathologies digestives et métaboliques. Cette structuration existe maintenant sur Toulouse au sein de l'INSTITUT de RECHERCHE en SANTE DIGESTIVE (IRSD) créé en Janvier 2016 et dont les membres partagent une vision commune de la promotion de la santé digestive.