Казахский государственный женский педагогический институт основан 15 августа 1944 года. Основанием для его открытия стало постановление Совета Народных Комиссаров Казахской ССР № 457 «О подготовке квалифицированных педагогических кадров из числа казахской женской молодёжи». Первоначально в его составе было создано три факультета: физико-математический, исторический, языка и литературы. В 1945 году открылся естественно-географический факультет, в 1968 — факультет музыки и песни. В 1971 году факультет языка и литературы был преобразован в филологический, а исторический факультет — в историко-педагогический. В 1984 году историко-педагогический факультет был разделён на исторический факультет и факультет дошкольного воспитания. После 1954 года несколько раз поднимался вопрос о закрытии института, поскольку он якобы выполнил своё предназначение, однако власти КазССР решили сохранить вуз. В 2000 году в составе института появились историко-филологический и экономический факультеты, а также факультеты естествознания и сервиса образования. C 2003 года в университете выходит собственная газета под названием «Актоты». С 2004 года в рамках Государственной программы развития образования на 2005—2010 годы в институте внедрена оригинальная система менеджмента качества и начинается переход к кредитной системе обучения, а также к двухступенчатой системе подготовки «бакалавриат — магистратура». В рейтинге Национального аккредитационного центра при Министерстве образования и науки Республики Казахстан университет с 2006 года занимает второе место среди педагогических учебных заведений. Указом Президента Республики Казахстан № 805 от 25 декабря 2018 года Казахскому государственному женскому педагогическому университету присвоен статус Национального.