Stichting Waterproef voert werkzaamheden uit voor Waternet en Hoogheemraadschap Hollands Noorderkwartier. Waterproef verricht onderzoek, voert projecten uit en levert advies op chemisch, fysisch, microbiologisch en hydrobiologisch gebied. Het onderzoek wordt uitgevoerd t.b.v. de kwaliteit van het oppervlaktewater, controle van de ruim 30 rioolwaterzuiveringsinstallaties en controle van lozingen van bedrijven en instellingen. Waterproef verricht tevens veel veldwerk, zoals het onderzoek naar de kwaliteit van het zwemwater voor openlucht recreatie en de inventarisatie van planten en dieren (o.a. weidevogeltellingen, stedelijk en landelijk wateronderzoek). Waterproef is geaccrediteerd volgens de NEN-EN-ISO/IEC 17025 norm.