La Fondation Saint-Jean-Eudes a pour mission de promouvoir la mission éducative que s'est donnée Saint-Jean-Eudes en l'appuyant dans la réalisation de ses projets éducatifs; de développer des projets, incluant des activités de financement, qui aideront Saint-Jean-Eudes à poursuivre sa mission éducative; d'appuyer différentes initiatives qui permettront le développement intellectuel, physique et psychologique de la clientèle étudiante de Saint-Jean-Eudes; de gérer un programme de bourses et de soutien financier au bénéfice de la clientèle étudiante de l'école et d'assurer un lien entre les finissants et leur alma mater, Saint-Jean-Eudes.