V roce 1952 byla ustavena Agronomická fakulta jako jedna z fakult nově založené samostatné Vysoké školy zemědělské. V roce 2005 došlo v souladu s rozšiřováním jejích aktivit k jejímu přejmenování na Fakultu agrobiologie, potravinových a přírodních zdrojů. Fakulta tím chtěla vyjádřit svůj posun od čistě zemědělsky orientované vzdělávací instituce k šíře koncipovanému studijnímu i vědecko výzkumnému zaměření moderní univerzity. Fakulta nabízí bakalářské studijní programy profesní (Fytotechnika, Zahradnictví, Zootechnika) i teoretické (Zemědělství, zahradnictví a rozvoj venkova; Udržitelné využívání přírodních zdrojů). Dalším stupněm je magisterské studium, které nabízí specializované programy Zootechnika, Fytotechnika, Rostlinolékařství, Zahradnictví, Genové technologie a šlechtění, Rozvoj venkova a zemědělství, Kvalita a zpracování zemědělských produktů, Péče o biosféru, Hodnocení a ochrana půdy a anglicky vyučovaný mezinárodní program Natural Resources and Environment.