O Centro de Estudos Unificados Bandeirante (CEUBAN) iniciou suas atividades em 20 de junho de 1968, sob a antiga denominação de Sociedade Civil de Educação Física de Santos. Em abril de 1969, foi criada a sua primeira faculdade – Faculdade de Educação Física, que funcionava nas dependências do Brasil Futebol Clube. Atualmente, a Faculdade de Educação Física – FEFIS está instalada no Campus II. A partir de 1972, começou a funcionar a Faculdade de Educação e Ciências Humanas “Prof. Laerte de Carvalho”, oferecendo os cursos de Pedagogia e Estudos Sociais. No mesmo ano, teve início a Faculdade de Ciências Comerciais e Administrativas de Santos, com os cursos de Administração de Empresas e Administração de Empresas com ênfase em Comércio Exterior, o primeiro curso do gênero no país. Em 1976, a instituição criou a Faculdade de Odontologia de Santos, oferecendo o curso de Odontologia e especialização nas áreas de prótese, endodontia, ortodontia e odontopediatria. A Faculdade de Odontologia, hoje, oferece cursos de especialização em 12 áreas, além de contar com diversas modalidades de clínicas para atendimento odontológico à comunidade, atingindo uma média de 500 procedimentos por dia. Nos anos 80, a UNIMES iniciou o curso de Ciências Econômicas (86), dentro da estrutura administrativa e acadêmica da Faculdade de Ciências Administrativas e Comerciais. Ainda em 1986, realizou alterações na estrutura organizacional, estabelecendo a fusão da Faculdade de Ciências Comerciais e Administrativas de Santos com a Faculdade de Economia. Dessa coalizão surge a Faculdade de Ciências Contábeis.