El Centro Nacional de Investigación en Imagenología e Instrumentación e Médica (CI3M) es una iniciativa de la División de Ciencias Básicas e Ingeniería de la UAM-Iztapalapa y dio inicio en el año 2004 como parte de la convocatoria emitida por el Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología: “Apoyos Complementarios para el Establecimiento de Laboratorios Nacionales de Infraestructura Científica o Desarrollo Tecnológico”, la UAM fue autorizada para recibir recursos e invertirlos en infraestructura del CI3M y fue nombrado Laboratorio Nacional por el Conacyt en el 2007. Cuenta con dos equipos de resonancia magnética, uno de 7 Tesla para investigación en pequeñas especies (VARIAN) y uno de 3 Tesla para humanos (PHILIPS) tanto para la clínica como para la investigación, además de un tomógrafo de 64 cortes, ultrasonido y un estimulador magnético transcraneal. El CI3M cuenta con profesionales altamente capacitados y es considerado el laboratorio más importante en el campo de la Imagenología de América Latina y uno de los primeros doce del mundo. El objetivo del centro es fortalecer la investigación, la formación de recursos humanos y la vinculación entre la academia, la empresa y el sector salud en proyectos tecnológicos de alto impacto dentro del campo de la ingeniería biomédica.