Cikal bakal Universitas Muhammadiyah Sidoarjo dirintis sejak tahun 1984 dengan dibukanya Sekolah Tinggi Ilmu Tarbiyah (STIT) yang kemudian baru secara resmi berdiri pada tahun 1987. Pada tahun 1987 itu pula didirikan Sekolah Tinggi Ilmu Pertanian (STIPER) dan Sekolah Tinggi Teknik Informatika dan Komputer (STIMIK). Sedangkan Sekolah Tinggi Ilmu Ekonomi (STIE) dan Sekolah Tinggi Ilmu Sosial dan Ilmu Politik (STISIP) berdiri pada tahun 1994. Pada tahun 2001 semua sekolah itu telah bergabung menjadi Universitas Muhammadiyah Sidoarjo, yang sekarang memiliki 5 fakultas, 22 Program Studi Strata 1 (S1), 2 program D4, dan 2 program pascasarjana. Selain itu, telah berdiri pula pusat-pusat studi untuk mendorong akselerasi riset dan pengembangan. Dalam rentang waktu tiga belas tahun tersebut, Universitas Muhammadiyah Sidoarjo telah mengalami perkembangan yang cukup berarti, baik dalam peningkatan status jurusan, pembenahan administrasi, penambahan sarana dan prasarana fisik serta fasilitas kampus, maupun peningkatan kualitas tenaga akademiknya.