A Faculdade São Sebastião tem sua sede na cidade de São Sebastião, um dos municípios mais antigos do Estado de São Paulo, sendo oficialmente reconhecida pelo MEC em 18 de novembro de 2003 e recredenciada através da Portaria nº889, publicada no DOU de 09 de julho de 2012. Em 2015, passou a fazer parte da Cruzeiro do Sul Educacional, um dos maiores grupos educacionais do País, composto pelo Colégio Cruzeiro do Sul, SP – SP; Universidade Cruzeiro do Sul, SP – SP; Centro Universitário Módulo, Caraguatatuba – SP; Centro Universitário do Distrito Federal, no Distrito Federal – DF; Universidade Cidade de São Paulo, SP – SP, Universidade de Franca e Colégio Alto Padrão, em Franca – SP; Faculdade São Sebastião e Colégio Objetivo São Sebastião – Centro, em São Sebastião – SP; Faculdade Caraguá, em Caraguatatuba – SP; Centro Universitário N. Sra. do Patrocínio, Colégio Objetivo – Itu e Salto – SP; Centro Universitário da Serra Gaúcha (FSG), em Caxias do Sul e Bento Gonçalves – RS; Faculdade Inedi – Cesuca, em Cachoeirinha – RS; Centro Universitário de João Pessoa, em João Pessoa – PB; unindo forças e criando uma operação mais forte, competitiva e apta a oferecer melhores opções de ensino para a formação de nossos alunos