MÜZE AŞ, tasarladığı ve uyguladığı müze projelerinin yanı sıra, tarihi yapıların yakın çevre bağlantıları, peyzaj ve mimari öğeleriyle birlikte korunması ve belgelenmesine yönelik rölöve, restitüsyon ve restorasyon projelerini hayata geçiriyor. MÜZE AŞ’nin 1999’da ziyarete açılan Bursa Arkeoloji Müzesi içerisindeki Araba Teşhir Salonu’yla başlayan müzecilik uygulamaları, Bursa Tofaş Anadolu Arabaları Müzesi, Bursa Kent Müzesi ve Yalova Kağıt Müzesi ile devam etti. Yine bu süreçte Kılıç Ali Paşa Medresesi, Türkiye Diyabet Vakfı Binası, Topkapı Sarayı Cephesi, tarihi İpekyolu üzerindeki Taraklı Hacı Atıflar Hanı, Fatih Külliyesi Tabhanesi, Ayasofya Müzesi dış cephesi, Ayasofya Müzesi kandillikleri ve hat levhâlârı ile Ayasofya Padişah Türbeleri restorasyonlarını gerçekleştirdi.Proje uygulamalarında mimarlık tarihi, sanat tarihi, arkeoloji, şehircilik vb konularda görsel ve yazılı kaynak araştırmalarına yer veren MÜZE AŞ, çalışmalarında geleneksel yapı malzemeleri ve yöntemlerini titizlikle kullanmaya özen gösteriyor.