Según la normativa vigente, la CSE cumple una labor relevante de asesoramiento al Consejo Directivo Central (CDC) en materia de políticas relacionadas con el desarrollo de la enseñanza y promueve iniciativas tendientes a fomentar la innovación educativa. Acorde a los fines, la CSE impulsa y financia proyectos de mejoramiento de la calidad de la enseñanza de grado, a través de fondos concursables y no concursables. Asimismo, desarrolla acciones de acompañamiento a las generaciones que ingresan a la universdidad, fomenta la formación docente a través de diversos programas de apoyo; organiza actividades centrales; establece relaciones de cooperación e intercambio académico con otras universidades, entre otras. Actualmente el órgano es presidido por el Mag. Fernándo Peláez.