A Faculdade de Ciências do Tocantins foi credenciada pela portaria ministerial nº 717 do (MEC), em 29 de maio de 2012. São oferecidos na graduação os cursos de Administração, Análise e Desenvolvimento de Sistemas (tecnológico) e de Odontologia. A instituição já existe desde 10 de novembro de 2005, quando funcionava como o Centro Superior de Tecnologia, Ensino, Pesquisa Pós - Graduação do Tocantins (CESTEP). A FACIT oferece cursos superiores nas áreas da saúde, ciências aplicadas, ciências exatas, ciências humanas, comunicação social e formação tecnológica, ensino a distância, pós-graduação Lato sensu e Stricto sensu. O papel da Faculdade de Ciências do Tocantins é o de atender a sociedade, e possibilitando a todos os cidadãos o compartilhamento dos avanços alcançados pelas ciências da saúde e tecnológica. A cidade de Araguaína foi escolhida para instalação da FACIT por ser uma das primeiras cidades da região norte do Tocantins que se constitui em centro propulsor de educação e cultura no norte do Brasil. Tal fato possibilita que a faculdade coloque em prática exigências para a oferta de cursos de graduação, como buscar convênios, estágios profissionais, produção de pesquisa e intercâmbio com organismos internacionais.