La Administración Portuaria de Puerto Madryn es un Ente Público no Estatal con personería jurídica y plena capacidad legal, de conformidad con las disposiciones del Código Civil Argentino, para el desarrollo de sus fines, pudiendo realizar toda clase de actos de administración y disposición con la sola limitación impuesta por la normativa portuaria. Este Ente está dirigido por un Consejo de Administración conformado por representantes de diferentes sectores gubernamentales y productivos: el mayor usuario (sector aluminio), la Cámara de Industria, Comercio, Producción y Turismo local, el Municipio local, el sector pesquero y los trabajadores.