Gebze Teknik Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü'ne bağlı Anabilim Dalları, verdikleri yüksek lisans ve doktora eğitimleri ile bilim ve teknolojideki güncel gelişmeleri takip edebilen, ileri düzeyde bilimsel araştırma yürütebilen, alanlarında önde gelen uluslararası bilimsel dergilerde yayın yapabilen ve disiplinlerarası işbirliğini sağlayabilen bilim insanlarını yetiştirmeyi amaçlamaktadır.