CONUDFI nace ante la necesidad de comprender la complejidad e importancia que tiene la logística en el desarrollo del comercio exterior del país. Así, CONUDFI nace de la fusión de la Comisión Nacional de Fletes y Tarifas y de la Comisión de Facilitación del Transporte y Comercio Internacional del Instituto de Comercio Exterior (ICE), y el Comité de Usuarios del Sistema de Distribución Física Internacional de la Confederación Nacional de Instituciones Empresariales Privadas (CONFIEP). Integra desde el 30 de abril de 1991 a Exportadores e Importadores en un organismo que los reúne y representa. Actualmente, CONUDFI está conformada por la Asociación de Exportadores – ADEX, Cámara de Comercio de Lima – CCL, Sociedad Nacional de Pesquería – SNP, Asociación Civil Frío Aéreo y Asociación Automotriz del Perú – AAP.