A Agência de Inovação do Café é um órgão vinculado às Pró-Reitoras de Pesquisa (PRP) e tem por finalidade desenvolver estudos, pesquisas, inovação e promover o empreendedorismo em temas relacionados ao café, sendo um deles, desenvolver projetos de pesquisas e inovação multidisciplinares que visem ao desenvolvimento do conhecimento científico, tecnológico e inovador e à solução de problemas demandados por órgãos ou instituições públicas ou privadas referentes ao agronegócio café.